חוג לימודים לתואר מוסמך האוניברסיטה במדעים M.Sc

ולימודים לתואר דוקטור לפילוסופיה

ראש החוג: פרופסור ניר ספיר

חברי הסגל האקדמי

פרופסור מן המניין: פרופסור אסף דיסטלפלד, פרופסור עדו יצחקי, פרופסור משה ענבר, פרופסור ציון פחימה, פרופסור שגיא שניר.

פרופסור חבר: , פרופסור ערן טאובר, פרופסור עדי ליבנת, פרופסור ניר ספיר.

מרצה בכיר: דוקטור איל פריבמן, דוקטור רמי רשף, דוקטור עמאד שמס .

מרצה: דוקטור שרית אברני.

גימלאים: פרופסור אלכסנדר בולשוי, דוקטור לאוניד ברודצקי, פרופסור אמוץ דפני, פרופסור סולומון ואסר, פרופסור גיורא חת, פרופסור אדוארד טריפונוב, פרופסור אברהם קורול,
פרופסור גדי קציר.

מזכירות החוג

עוזר מינהלי לראש החוג: גברת מיכל ליבסטר

כתובת דואר אלקטרוני:  mliebst1@univ.haifa.ac.il

בניין רב־תכליתי, קומה 1, חדר 191

טלפון: 04-8249943

אתר החוג

שעות קבלה: ימים א׳-ה׳, בין השעות 12:00-10:00

הלימודים לתואר מוסמך האוניברסיטה במדעים (M.Sc)

יושב ראש הוועדה החוגית לתואר שני: פרופסור שגיא שניר

תנאי קבלה

לחוג יתקבלו בוגרי תואר ראשון במדעי החיים (B.Sc) ממוסד מוכר להשכלה גבוהה בארץ או בחוץ לארץ, שציונם הסופי המשוקלל הוא לפחות 83.
מועמד המגיע מדיסצפלינה אחרת או שממוצע הציונים שלו נמוך מהסף החוגי, קבלתו תידון בועדת הקבלה החוגית.

מועמדים ללימודים יתבקשו להעביר עם הרשמתם למחלקת הרשמה אסמכתאות מקור של לימודיהם הקודמים:תעודה וגליון ציונים חתומים על ידי המוסד. כמו כן יגישו למזכירות החוג שני מכתבי המלצה מטעם מורים אשר הכירו אותם בלימודיהם הקודמים ומכתב קצר המפרט את המניעים להשתלבות בחוג ובמידת האפשר את הנושאים אותם הם מעוניינים לחקור.

המועמדים נדרשים ליצור קשר עם מנחה פוטנציאלי למחקרם לתיזה כתנאי לקבלתם ללימודים בחוג.

המועמדים יוזמנו לראיון אישי בפני ועדת הקבלה. הוועדה רשאית, על פי שיקוליה, להחמיר או להמליץ להקל מתנאי הקבלה הנזכרים לעיל, ובתנאי שאלה לא יעמדו בסתירה לתנאי הקבלה הכלל־אוניברסיטאיים. ועדת הקבלה תמליץ בפני הרשות ללימודים מתקדמים על קבלה ללימודים, אולם, ההחלטה הסופית על אישור הקבלה נתונה בידי הרשות ללימודים מתקדמים.

מועמד בעל תואר ראשון ממוסד מוכר להשכלה גבוהה, ששפת ההוראה בו אינה עברית, חייב לעמוד בבחינת ידע בעברית ברמה הנדרשת על ידי האוניברסיטה כתנאי לקבלתו ללימודים.

מועמדים בוגרי אוניברסיטאות מוכרות מחו״ל וכן בוגרי אוניברסיטאות בעלות שלוחות בישראל, אשר פועלות באישור המועצה להשכלה גבוהה, יחויבו לעמוד בהצלחה במבחן GRE או בלימודי השלמה במסגרת התואר הראשון. לפרטים נוספים, יש לפנות לתקנון לימודים לתואר שני ו/או לוועדה החוגית לתלמידי מוסמך.

מבנה הלימודים
הלימודים בחוג הם במסלול א׳ בלבד, הכולל כתיבת תיזה.
משך הלימודים כולל הגשת התזה – שנתיים.

התלמיד ישלים קורסים בהיקף 28 שש"ס לפחות באישור ובהתייעצות המנחה ובאישור הועדה החוגית ללימודים מתקדמים, לפי הפירוט הבא:
קורסי חובה המשותפים לכל תלמידי התוכנית בהיקף של 14 שעות שבועיות סמסטריאליות.

קורסי בחירה בהיקף של 14 שעות שבועיות סמסטריאליות אותם נוטל כל תלמיד באישור המנחה לעבודת התיזה.

ביצוע מחקר שיוגש כעבודת גמר מחקרית (תזה) והצגת העבודה במסגרת החוג.
קורסי חובה בהיקף 14 שש"ס
תכנון ניסויים, איסוף נתונים וניתוח תוצאות מדעיות     4 שעות שבועיות סמסטריאליות
(יינתן באנגלית)

פרקים נבחרים באבולוציה אורגניזמית                          2 שעות שבועיות סמסטריאליות

יסודות האבולוציה המולקולרית                                     2 שעות שבועיות סמסטריאליות

אקולוגיה של אוכלוסיות                                                2 שעות שבועיות סמסטריאליות

גנטיקה של  אוכלוסיות                                                  2 שעות שבועיות סמסטריאליות

פורום תלמידי מחקר (סמסטר א׳+ב׳)                             2 שעות שבועיות סמסטריאליות
שימו לב: חובת הנוכחות בפורום היא בהיקף של 80% לפחות במהלך התואר. התלמיד יציג בפורום את הצעת המחקר שלו בסוף שנה א' ללימודיו. עם סיום  עבודת המחקר התלמיד יציג בפורום את תוצאותיו וזאת 
בתיאום עם האחראי על הפורום.

קורסי בחירה בהיקף 14 שש"ס
קורסי הבחירה המפורטים להלן הם בהיקף של 4-2 שעות שבועיות סמסטריאליות. הסטודנט ירכיב את מערכת השעות בהיקף של לפחות 14 שעות שבועיות סמסטריאליות. חלק מקורסי הבחירה של 2 שעות שבועיות סמסטריאליות משותפים לתוכניות נוספות לתואר שני. קיומו של קורס בחירה מותנה במספר מינימלי של נרשמים על פי המקובל באוניברסיטה בלימודי מוסמך.

התפתחות עוברית ומנגנוני אבולוציה                            2 שעות שבועיות סמסטריאליות

יחסי גומלין צמחים ובעלי חיים                                     3 שעות שבועיות סמטריאליות + 1 שעה תרגיל/מעבדה/סיור

מיפוי גנומי                                                                    2 שעות שבועיות סמסטריאליות

שעונים ביולוגיים                                                           2 שעות שבועיות סמסטריאליות

מיקרוביולוגיה סביבתית                                                 2 שעות שבועיות סמסטריאליות

אבולוציה מיקרוביאלית                                                 2 שעות שבועיות סמסטריאליות

ביוסטטיסטיקה למתקדמים                                           4 שעות שבועיות סמסטריאליות

פטריות קרקע: מגוון, אקולוגיה וחשיבות כלכלית          2 שעות שבועיות סמסטריאליות

קורס R                                                                           3 שעות שבועיות סמסטריאליות

תכנות ב-Python לביולוגים                                            3 שעות שבועיות סמסטריאליות

מבוא לבניית עצי תורשה                                                 2 שעות שבועיות סמסטריאליות

מדוע סקס: המסתורין של רקומבינציה סקסואלית         2 שעות שבועיות סמסטריאליות

קו-אבולוציה של יחסי טפיל-פונדקאי במחלות צמחים    2 שעות שבועיות סמסטריאליות

ביולוגיה מולקולארית ותאית בתנאי עקה                         3 שעות שבועיות סמסטריאליות

פיזיולוגיה השוואתית של בעלי חוליות                            2 שעות שבועיות סמסטריאליות

              מחלות צמחים                                                                   3 שעות שבועיות סמסטריאליות

אבולוציה של התנהגות                                                      2 שעות שבועיות סמסטריאליות

סדנא בביואינפורמטיקה (קורס מרוכז)                                                    3 שעות שבועיות סמסטריאליות

שיטות מחקר בביואינפורמטיקה                                        4 שעות שבועיות סמסטריאליות

נדידת ציפורים (קורס מרוכז)                                                                    4 שעות שבועיות סמסטריאליות

ייתכנו שינויים בקטלוג קורסי הבחירה
חלק מהקורסים יוצעו אחת לשנתיים וחלקם ינתנו בשפה האנגלית

קורסים/ השתלמויות ללא קרדיט (לא ייחשבו במניין השעות לתואר)

סמינר מחלקתי: חובת נוכחות ב  40 מפגשים במהלך התואר.

בטיחות במעבדה יש להשלים הסדנה במהלך השנה הראשונה ללימודים.

הסמכה למחקר בבעלי חיים– מיועד לתלמידים אשר עבודת התיזה שלהם כוללת מחקר בבעלי חיים

תנאי מעבר משנה א׳ לשנה ב׳

תלמידים שנכשלו בשני קורסי חובה או יותר לא יוכלו להמשיך את לימודיהם בחוג.

תלמידים שנכשלו בקורס חובה יצטרכו לחזור עליו שנית בשנה העוקבת. במידה ויכשלו שוב לא יוכלו להמשיך את לימודיהם בחוג.

ציון מעבר בקורס הוא 66.

תנאי מעבר משנה א׳ לשנה ב׳ ממוצע 76.

ציון סופי
הציון הסופי יורכב כדלקמן:

30% ציוני הקורסים והעבודות הסמינריוניות.

50% עבודת התיזה. התיזה תישלח להערכה גם לבוחן חיצוני.

20% בחינת גמר בע״פ בתחום התמחותו של התלמיד. הבחינה תיערך בהשתתפות המנחה, והבוחן החיצוני של התיזה ויושב ראש ועדת הבחינה.

תלמידי החוג מתבקשים לעיין בתקנון האוניברסיטאי ללימודים לתואר שני לקבלת פרטים נוספים, כמו: משך הלימודים, בחינות, ציונים ועבודות, הפסקה/חידוש/הארכה/חופשה מלימודים, נוהל ערעור על ציוני קורסים, עבודת מחקר ועוד.

כתובת האתר: http://graduate.haifa.ac.il/index.php/he

לימודים לתואר מוסמך האוניברסיטה במדעים M.Sc. בביולוגיה אבולוציונית וסביבתית עם התמחות בביואינפורמטיקה

ראש התכנית: דוקטור איל פריבמן

טלפון: 054-5224888

eprivman@univ.haifa.ac.il

בחוג לביולוגיה אבולוציונית וסביבתית קיים מסלול מיוחד: לימודים לתואר M.Sc. בביולוגיה אבולוציונית וסביבתית עם ספח התמחות בביואינפורמטיקה (ספח המוצמד לאישור הזכאות בגמר התואר). ביואינפורמטיקה הינו מקצוע מתפתח וחשוב, התופס חלק הולך וגדל בענפי המחקר והתעשייה העתידיים. כמויות המידע הביולוגי המצטברות וההתפתחות המרשימה בענפי הביוטכנולוגיה, במיוחד בעקבות מהפכת טכנולוגיות הריצוף, הציבו אתגרים חדשים בפני המדע והתעשייה והובילו להתפתחות מקצוע בין-תחומי זה. ביואינפורמטיקה מביאה שיטות מתחום מדעי המחשב, המתמטיקה והסטטיסטיקה, לאתגרים בניתוח מאגרי מידע אדירים של רצפים גנומיים ונתונים נוספים, כדי לתת מענה לשאלות ובעיות בחזית המחקר במדעי החיים והרפואה.

תנאי קבלה
התוכנית מיועדת לסטודנטים בוגרי תואר ראשון B.Sc. במדעי הטבע (כולל ביולוגיה), מדעים מדוייקים והנדסה. יתקבלו בוגרי תואר ראשון ממוסד מוכר להשכלה גבוהה בארץ או מחוץ לארץ בציון סופי 85. בנוסף נדרש ציון 80 לפחות בקורסים המתמטיים. מועמדים יוזמנו לראיון אישי בוועדת קבלה חוגית המורכבת מאנשי סגל בחוג לביולוגיה אבולוציונית וסביבתית וחברי סגל בפקולטה למדעי הטבע. הוועדה רשאית, על פי שיקוליה, להחמיר או להקל בתנאי הקבלה הנזכרים לעיל. על המועמדים ליצור קשר עם מנחים פוטנציאלים עוד בטרם החלו בהליך ההרשמה.

מועמדים בוגרי אוניברסיטאות מוכרות מחוץ לארץ וכן בוגרי אוניברסיטאות בעלות שלוחות בישראל, אשר פועלות באישור המועצה להשכלה גבוהה, יחויבו לעמוד בהצלחה במבחן GRE או בלימודי השלמה במסגרת התואר הראשון. לפרטים נוספים, יש לפנות לתקנון לימודים לתואר שני ו/או לוועדה החוגית לתלמידי מוסמך.

מבנה הלימודים
הלימודים במסלול ההתמחות בביואינפורמטיקה הם במסלול א׳ בלבד, הכולל ביצוע מחקר וכתיבת עבודת גמר מחקרית (תזה). משך הלימודים בתכנית הוא שנתיים כולל כתיבת תיזה, כשעל התלמיד להשלים קורסים בהיקף 28 שעות שבועיות סמסטריאליות לפחות (לא כולל לימודי השלמות).
התלמיד יבנה תכנית לימודים אישית בתאום עם המנחה של עבודת הגמר ובאישור ראש התכנית.
ניתן ללמוד קורסים מתחומי הביולוגיה או קורסים ייעודים מחוגים אחרים הנדרשים לצורך השתלמות הסטודנט.

קורסי חובה בביולוגיה אבולוציונית וסביבתית בהיקף 14 שש"ס
לפי הפירוט לעיל במסגרת תכנית הלימודים של החוג.

קורסי בחירה בביולוגיה אבולוציונית וסביבתית בהיקף 5 שש"ס לפחות
לפי הפירוט לעיל במסגרת תכנית הלימודים של החוג.

סטודנט שלא לא למד קורס תכנות במסגרת לימודים קודמים ידרש להשלים במסגרת קורסי הבחירה אחד מקורסי התכנות הבאים:
תכנות ב-Python לביולוגים                                                             3 שעות שבועיות סמסטריאליות
תכנות ב MATLAB                                                                          2 שעות שבועיות סמסטריאליות

קורס חובה בביואינפורמטיקה
שיטות מחקר בביואינפורמטיקה (שיעור ותרגיל)                            4 שעות שבועיות סמסטריאליות

חובת בחירה בביואינפורמטיקה        5 שש"ס לפחות

אלגוריתמים בגנומיקה חישובית (שעור ותרגיל)                              3 שעות שבועיות סמסטריאליות

שיטות הסתברותיות בגנומיקה (נדרש רקע במדעי המחשב)           3 שעות שבועיות סמסטריאליות

מיפוי גנומי                                                                                       2 שעות שבועיות סמסטריאליות

סדנא בביואינפורמטיקה (סדנא מרוכזת בחופשת הסמסטר)          3  שעות שבועיות סמסטריאליות

בקרת גנים במהלך התפתחות עוברית ובאבולוציה (ביולוגיה ימית)  3 שעות שבועיות סמסטריאליות

יסודות האבולוציה המולקולרית                                                        2 שעות שבועיות סמסטריאליות

שעונים ביולוגיים                                                                               2 שעות שבועיות סמסטריאליות

אבולוציה מיקרוביאלית                                                                      2 שעות שבועיות סמסטריאליות

סמינר מחקר בביולוגיה כמותית ומודלים (ביולוגיה ימית)                   2 שעות שבועיות סמסטריאליות

ביואינפורמטיקה מבנית                                                                       3 שעות שבועיות סמסטריאליות

קורס R                                                                                  3 שעות שבועיות סמסטריאליות

ייתכנו שינוים בקטלוג הקורסים, חלק מהקורסים יינתנו באנגלית

קורסים/השתלמויות ללא קרדיט (לא ייחשבו במניין השעות לתואר)
סמינר מחלקתי חובת נוכחות ב  40 מפגשים במהלך התואר.

בטיחות במעבדה יש להשלים הסדנה במהלך השנה הראשונה ללימודים.

הסמכה לסטודנטים למחקר בבעלי חיים– מיועד לתלמידים אשר עבודת התיזה שלהם כוללת מחקר בבעלי חיים

הלימודים לתואר דוקטור לפילוסופיה (Ph.D)

יושב ראש הוועדה החוגית לתואר שלישי:  דוקטור עמאד שמס

תכנית הלימודים מיועדת להכשיר את מסיימיה לעבודה במחקר במדעי החיים. קיימת אפשרות לביצוע מחקרים בשדה ובמעבדה בשיטות מולקולריות מודרניות בשילוב עם מחקרים תיאורטיים הכוללים מודלים בגנטיקה מתמטית, ביואינפורמטיקה, האבולוציה והמגוון של הגנום, במספר  אורגניזמי-מודל מבקטריות ליונקים וצמחים עילאיים, יחסי גומלין בין צמחים ובעלי חיים, אנרגטיקה, אקולוגיה, שמירת טבע, אקופיסיולוגיה, כרונוביולוגיה ואבולוציה של תהליכי התפתחות עוברית.

תנאי קבלה

יתקבלו מועמדים מצטיינים בעלי תואר מוסמך (M.Sc או תואר מקביל) במסלול עם כתיבת תיזה בתחומי מדעי החיים כגון ביולוגיה, חקלאות, ביוטכנולוגיה, ביואינפורמטיקה או מדעי הרפואה, שהגישו עבודת תיזה שאושרה. יתקבלו מועמדים בעלי ציון כללי ממוצע של 85 לפחות לתואר מוסמך, כאשר הציון על עבודת התיזה הוא 86 לפחות (טוב מאוד). תלמידים שבידם עותק של מאמר שהתפרסם ממחקר המוסמך שלהם או כתב־יד שנשלח לפרסום בכתב־עת מדעי בינלאומי, או שהציגו בפועל את מחקרם בכנס בינלאומי יזכו לעדיפות.

מועמדים העומדים בקריטריונים לקבלה ידרשו להתקשר עם מנחה פוטנציאלי (חבר סגל בדרגת מרצה בכיר ומעלה, או חבר סגל מדרגת מרצה ובשיתוף פעולה עם חבר סגל אחר מדרגת מרצה בכיר ומעלה), לסכם על נושא ולהעביר למזכירות החוג המלצת המנחה המיועד ונושא המחקר וכן הצהרת כוונות שתכלול הצגה של בעיית המחקר ושל שיטות המחקר העיקריות.
בשלב זה המזכירות תשלח למועמד הנחיות להכנת תיק מועמדות שיועבר לועדת הקבלה החוגית.

תכנית המחקר והלימודים
משך תכנית המחקר והלימודים תהיה ארבע שנים. לקבלת התואר ״דוקטור לפילוסופיה״ ידרשו התלמידים למלא את התנאים הבאים:

א. השלמת קורסים בהיקף 8 שש"ס:
קורס חובה כתיבה וניסוח מדעיים                         2 שעות שבועיות סמסטריאליות

קורסי בחירה באישור המנחה והועדה החוגית        6 שעות שבועיות סמסטריאליות       

חובת השתתפות ללא קרדיט: סמינר מחלקתי חובת נוכחות ב 60 מפגשים במהלך התואר.

פורום מחקר חובת נוכחות של 80% לפחות במהלך התואר. בנוסף, התלמיד יציג הצעת המחקר בסוף שנה א לאחר הגשתה לשיפוט וכן את תוצאות עבודת המחקר עם סיומה וזאת בתיאום עם האחראי על הפורום. 

הערה: תלמיד שיבקש ללמוד קורסים מחוג או מוסד אחר יעביר בקשתו בצרוף המלצת המנחה לועדה החוגית ללימודי דוקטורט.

ב. תוכנית המחקר ואישורה
במהלך השנה הראשונה יהיו התלמידים במעמד של תלמידי מחקר שלב א׳. עם הגשת הצעת המחקר ולא יאוחר מסוף שנת הלימודים הראשונה תמנה הרשות ללימודים מתקדמים ועדה מלווה לכל דוקטורנט על בסיס המלצת הוועדה החוגית.

במהלך השנה הראשונה יכתבו התלמידים את התוכנית המפורטת למחקר הדוקטורט באנגלית בפורמט המקובל של הצעת מחקר לאקדמיה הישראלית למדעים כולל תוצאות ראשוניות. תכנית המחקר תהיה מקורית ובעלת סיכוי טוב לקידום הידע וההבנה בתחום הנחקר.

הצעת המחקר תבדק על ידי הוועדה המלווה, תוצג לה ותאושר על ידי ועדת הדוקטורט החוגית. לאחר אישור הוועדה יעברו הסטודנטים למעמד של תלמידי מחקר שלב ב׳ בכפוף לאישור הרשות ללימודים מתקדמים.

ג. ביצוע המחקר ודוח התקדמות
בתחילת כל שנת לימודים יגיש התלמיד דו"ח התקדמות לרשות ללימודים מתקדמים לאחר אישור המנחה וועדת הדוקטורט החוגית.

במידה ויידרש, על הסטודנט יהיה להציג את התקדמות המחקר בפני הוועדה המלווה . לפני תום הדוקטורט תתכנס הוועדה המלווה על מנת לאשר את כתיבת התיזה והגשתה.

ד. הגשת עבודת הדוקטורט לשיפוט
עם סיומו, יסוכם המחקר באחת משתי הדרכים הבאות לפי המלצת המנחה והוועדה המלווה ובאישור ועדת הדוקטורט החוגית:

(1) דוקטורט פרסומים בהתאם לתקנון לימודי לתואר שלישי. 

(2) חיבור רגיל, על פי תקנון האוניברסיטה ללימודים לתואר שלישי.

לאחר אישור הוועדה המלווה את הגשת עבודת הדוקטורט תוצגנה תוצאות המחקר על־ידי התלמיד בפורום מחקר.

ה. שיפוט עבודת הדוקטורט  
לאחר אישור הגשת העבודה לשיפוט על ידי המנחה, הוועדה המלווה והוועדה החוגית, תועבר
עבודת הדוקטור לרשות ללימודים מתקדמים להמשך הליך השיפוט בהתאם לתקנון ללימודי תואר שלישי.

מסלול לימודים ישיר לדוקטורט
למסלול זה יוכלו להתקבל תלמידים לאחר סיום לימודי תואר ראשון B.Sc בהצטיינות.

ועדת הדוקטורט החוגית תדון בכל בקשה ותקבל בכל שנה את התלמידים הראויים ביותר. כמו כן, תלמידים שהשלימו קורסים בציון מספרי בהיקף של 13 שעות שבועיות סמסטריאליות בלימודי תואר שני בביולוגיה אבולוציונית וסביבתית בהצטיינות (ציון ממוצע של 90 לפחות), ונושא המחקר שלהם הוגדר ואושר על ידי מנחה/י העבודה, יוכלו להגיש מועמדות לעבור למסלול הישיר לדוקטורט בסוף שנת הלימודים הראשונה בלבד. ועדת הדוקטורט תדון בבקשות אלה ותאשר את קבלת התלמידים המתאימים למסלול.

בכל מקרה, על התלמידים משתי האפשרויות להשלים קורסים בציון מספרי ברמת תואר שני בחוג לביולוגיה אבולוציונית סביבתית (M.Sc) בהיקף של 26 שעות שבועיות סמסטריאליות לפחות.